Depuis des millions d'années, l'humain a coévolué avec un microbiote intestinal complexe, qui joue un rôle crucial dans sa santé et son bien-être. Cependant, l'industrialisation a entraîné des changements radicaux dans notre mode de vie et notre alimentation, modifiant ainsi profondément notre microbiote intestinal. De nombreuses études, dont celle de Li et al. (2025), ont démontré que ces perturbations du microbiote sont liées à une augmentation des maladies chroniques, dont les maladies cardiovasculaires, le diabète et l'obésité.
1. L'impact de l'industrialisation sur le microbiote intestinal
L'industrialisation a entraîné une réduction drastique de la diversité du microbiote intestinal, un phénomène observé dans les populations vivant dans des environnements industrialisés.
Plusieurs facteurs en sont responsables :
- Alimentation transformée et raffinée : Les régimes occidentaux riches en sucres raffinés, en graisses saturées et en additifs privent le microbiote des fibres essentielles à son équilibre.
- Perte de microbes bénéfiques : Les microbes qui dégradent les fibres et régulent l'immunité sont en nette diminution. En revanche, certaines bactéries pro-inflammatoires, comme Bilophila, sont en augmentation.
- Usage excessif d'antibiotiques et de césariennes : ces pratiques perturbent la transmission naturelle des microbes d'une génération à l'autre et altèrent la composition du microbiote.
2. Conséquences du microbiote industrialisé sur la santé
Ces changements ont des répercussions majeures sur la santé :
- Une réduction de la fermentation des fibres entraîne une diminution des acides gras à chaîne courte, essentiels à la santé intestinale et métabolique.
- Un appauvrissement enzymatique empêche une bonne assimilation des glucides complexes présents dans les aliments non transformés.
- Une augmentation des bactéries pro-inflammatoires favorise les maladies chroniques liées à l'inflammation.
3. Peut-on restaurer notre microbiote ?
Face à cette situation, les chercheurs explorent des stratégies pour restaurer un microbiote plus sain. Li et al. (2025) ont mené un essai clinique sur un régime alimentaire inspiré des populations non industrialisées, combiné à l'administration de Limosilactobacillus reuteri, une bactérie absente des microbiotes occidentaux mais présente chez les populations rurales de Papouasie-Nouvelle-Guinée.
Les résultats sont prometteurs :
- Le régime a corrigé certaines altérations du microbiote causées par l'industrialisation.
- Il a également modifié favorablement les métabolites sanguins dérivés du microbiote, impliqués dans les maladies chroniques.
- Enfin, il a généré des bénéfices cardiométaboliques significatifs, indépendamment de l'administration de L.reuteri.
Vers des recommandations alimentaires adaptées :
Ces découvertes renforcent l'idée que la nutrition joue un rôle essentiel dans la santé intestinale et globale. Plutôt que d'essayer de recréer un microbiote ancestral, il semble plus pertinent de favoriser une alimentation riche en fibres, en légumineuses, en aliments fermentés et en prébiotiques.
4. Conclusion
L'industrialisation a bouleversé notre microbiote et favorise l'émergence des maladies chroniques. Restaurer un équilibre sain passe avant tout par une alimentation adaptée, inspirée des régimes traditionnels riches en nutriments favorables au microbiote. Ces avancées ouvrent la voie à de nouvelles stratégies nutritionnelles et thérapeutiques pour préserver notre santé à long terme.
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